La dinámica de poblaciones se investiga en la colonia residente de aves guaneras: el guanay (Phalacocorax bougainvillii), el pelícano peruano (Pelecanus thagus) y el piquero peruano (Sula variegata).
El objetivo de esta investigación es entender la variación intra e interanual de las poblaciones residentes de aves guaneras que habitan en la reserva Punta San Juan.
Mediante la observación directa y uso de mapas satelitales a escala, el personal de Agrorural estima el número de aves guaneras cada semana a lo largo de todo el año, y con un mayor esfuerzo (diario) en las temporadas reproductivas. Esto se logra utilizando un estimado de densidad diferente para época reproductiva y no reproductiva.
Esta información nos permite entender la tendencias poblaciones a largo plazo, la variación interanual y la variación intra anual de las poblaciones residentes de aves guaneras.