La salud de poblaciones se investiga en la colonia residente de aves guaneras: el guanay (Phalacocorax bougainvillii), el pelícano peruano (Pelecanus thagus) y el piquero peruano (Sula variegata).
El objetivo de este estudio es generar una serie de valores referenciales de línea base sobre la salud poblacional de estas especies y el descarte de enfermedades infecciosas. Esto servirá para el monitoreo de la salud de la población aviar a largo plazo.
Se realizaron campañas de salud animal en el 2008 con expertos veterinarios que toman muestras para evaluar la salud, enfermedades emergentes (influenza aviar, cólera aviar, etc.) en la población aviar de guanay y pelícanos. También se realizó en una oportunidad para realizar un descarte de enfermedades infecciosas emergentes en estas poblaciones.